강좌 정보
2026 제20회 통계유전학워크샵
20th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
09. 한국인 판지놈 프로젝트 그래프 초안(참여자 128명) 활용 실습
주강사
김준 (충남대학교), 김영진 (국립보건연구원)
조교
김서연 (충남대학교), 최낙현 (국립보건연구원)
날짜
2026.07.21 09:20 ~ 2026.07.22 17:10
강좌 방식
Day 1: 온라인(녹화) // Day 2: 오프라인
강좌 정보

국립보건연구원에서는 현재 한국인 1000명을 대상으로 고품질 유전체 지도 2000개를 확보하는 한국인 판지놈 프로젝트(Korean Pangenome Project; KPP)를 수행하고 있다. 해당 연구의 시범 사업을 통해 현재 한국인 128명의 유전체 지도 256개가 확보됐으며, 이를 종합한 그래프 기반 범유전체 참조 지도 초안(Graphical pangenome reference, draft version)이 구축된 바 있다. 본 강의에서는 KPP의 배경과 결과를 소개하고, 해당 그래프 초안을 기반으로 기존에 구축된 NGS 데이터를 활용하기 위한 실습을 진행할 예정이다. 이를 통해 현재 전세계적으로 진행되고 있는 롱리드시퀀싱 기반 신규 표준 구축 사업에 대해 이해하고, 그 데이터를 적극 활용하기 위한 기반을 마련하고자 한다.

다음 링크에서 자세한 내용 확인 가능하다: https://github.com/KoreanPangenome/KPPD

기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타 (서버 접속 및 실습)
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
서버 접속이 목적이므로 인터넷만 잘 되는 수준이면 충분함. 윈도우 사용자는 MobaXterm을 설치하시는 걸 추천하고, 맥을 포함한 unix 기반 OS를 활용하는 사용자는 ssh를 활용해 터미널에서 접속하는 방법을 확인하면 좋음.
수강생 수준
강좌 난이도: 중 / 수강생 수준: Linux 기본 명령어 활용 가능한 수준 또는 claude code/codex 등을 이용해 서버 내 작업 가능한 수준
수강생 준비물
-
기타 안내사항

Linux 환경에서 작업해본 적이 없다면 아래 링크에 있는 자료를 활용하여 숙지하시기를 권장함. Task01까지 숙지하는 것이 필요하며, 가능하면 나머지도 숙지하시길 권장함.

https://github.com/JunKimCNU/JunKimLabTutorial

교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 비대면~90분 한국인 판지놈 프로젝트 소개 김영진 강의
Day 1 Session 2 비대면~90분 롱리드 시퀀싱 기법과 유전체 조립 김준 강의
Day 1 Session 3 비대면~90분 유전체 지도를 활용한 그래프 구축 김준 강의
Day 1 Session 4 비대면~90분 품질 검증 및 그래프 기반 변이 분석 김준 강의
Day 2 Session 5 9:20~10:00 1일차 내용 요약 김준 강의
Day 2 Session 6 10:20~11:50 KPP 그래프 설명 및 이를 활용한 NGS 분석 김준 강의
Day 2 Session 7 13:30~15:00 유전체 지도 기반 구조 변이 분석 실습 김준 강의/실습
Day 2 Session 8 15:10~16:10 vg giraffe 파이프라인 실습 김준 실습
Day 2 Session 9 16:20~17:10 DRAGEN-GRAPH 파이프라인 실습 김준 실습