최근 급속도로 발전하는 공간 전사체(Spatial transcriptomics) 기술은 기존의 단일세포 전사체 분석으로는 불가능했던 조직 내 세포들의 공간적 분포와 상호작용을 가능하게 하였다. 특히 Xenium, Visium HD, MERSCOPE, CosMx 등 다양한 상용 플랫폼이 출시되면서, 이러한 데이터의 분석과 해석이 생물학 연구의 핵심 과제로 대두되고 있다.
본 강의에서는 먼저 대용량 공간 전사체 데이터를 효율적으로 처리할 수 있는 리눅스 기반 분석 시스템 구성 및 Python 기반의 공간 전사체 분석 패키지(Scanpy, Squidpy 등) 설치 방법을 중점적으로 다룬다.
이후 공간 전사체 데이터의 분석을 위한 다양한 분석 기법들을 소개하고, 각 기법의 원리를 파악하고 구현하는 방법을 학습한다. 분석 시스템 구축부터 데이터 처리, 시각화, 해석에 이르는 전체 과정을 경험하며, 이러한 분석 기법들을 실제 데이터에 적용하여 생물학적 의미를 도출하는 과정을 실습한다.