강좌 정보
2025 제19회 통계유전학워크샵
19th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
단일세포전사체 응용 #3: 면역분석
주강사
홍승희 (연세대학교)
조교
최화진, 이경천, 윤성민, 송우현 (연세대학교)
날짜
2025.07.23 09:20 ~ 2025.07.24 17:10
강좌 방식
오프라인
강좌 정보

이 강의는 환자 유래 샘플에서 얻어진 단일세포 전사체 데이터를 활용해 면역세포의 이질성, 세포 간 상호작용, 분화 경로를 이해하고, TCR 시퀀싱 및 공간전사체 데이터와의 통합 분석 기법을 실습 중심으로 학습함. 교육은 실제 데이터를 기반으로 이론 설명과 Python을 이용한 실습을 병행하여 진행됨.


주요 학습 목표:

  • 단일세포 전사체(scRNA-seq)의 면역 분석 전략 이해
  • 다양한 cell-type annotation 방법 습득
  • trajectory 및 pseudotime 분석의 원리와 실습
  • 면역세포 간 상호작용 분석(Cell-cell communication)
  • TCR 시퀀싱 및 멀티오믹스 통합 분석 적용
  • 공간전사체 데이터와의 연계 분석 전략 이해
기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
RAM 최소 8GB 이상 권장, 인터넷 연결 필수 (패키지 설치 및 데이터 다운로드)
수강생 수준

강좌 난이도: 상-중 /

수강생 수준: 단일세포 전사체 분석에 입문하고 싶거나 좀 더 중-고급 수준의 면역분석을 시도해보고 싶은 분

수강생 준비물
개인 노트북
기타 안내사항
-
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 09:20~10:50 단일세포 전사체 분석 기본 및 면역학 응용 개요: scRNA-seq workflow 개론 홍승희 강의
Day 1 Session 2 11:00~12:30 Immune cell annotation 및 다양한 분석법 홍승희 강의
Day 1 Session 3 14:00~15:30 QC 및 Upstream 분석 실습 최화진 강의/실습
Day 1 Session 4 15:40~17:10 Cell type annotation과 public data 응용: immune cell subtype 세분화 전략 윤성민 강의/실습
Day 2 Session 1 09:20~10:50 Trajectory / Pseudotime analysis 실습: Monocle3, Slingshot, scVelo, scFates 송우현 강의/실습
Day 2 Session 2 11:00~12:30 Cell-cell interaction 분석 실습: CellChat, NicheNet, CellphoneDB 송우현 강의/실습
Day 2 Session 3 14:00~15:30 멀티오믹스 연관분석 실습: paired scRNA + TCR 데이터 분석 이경천 강의/실습
Day 2 Session 4 15:40~17:10 멀티오믹스 연관분석 실습: AI-based training + immune map overlay 이경천 강의/실습