생명공학, 유전체학은 방대한 양의 데이터를 다루는 학문이며, 시퀀싱의 결과물은 필연적으로 다수의 샘플과 메타데이터, 중간데이터, 시뮬레이션의 과정을 통해 대량의 데이터를 산출물로 남기게 됩니다. 따라서 데이터 저장, 전송, 분석, 그리고 분석도구 및 파이프라인 활용을 위해서는 코드뿐만 아니라 서버의 구성과 IT 인프라, 자원관리에 대한 이해를 가져야만 합니다.
오늘날 IT 환경을 구축하기 위한 비용은 가파르게 상승하고 있어, 생명공학/유전체학 연구자가 IT 시스템과 구성(서버, 클러스터, 클라우드 등)을 이해하는 것은 선택이 아니라 연구 생산성을 높이고 생존 경쟁력을 확보하기 위한 필수역량이 되었습니다.
본 강의에서는 제한된 예산 하에 연구, 개발을 위한 시스템을 구축하고자 하는 초·중급 연구자를 대상으로 효율적인 시스템의 구축 및 방안, 그리고 최근 트렌드를 공유하고자 합니다.
Oracle Virtualbox 7.0.x 구동되는 환경의 노트북 ( Linux, Windows, Intel CPU 기반의 Macbook )
최소 권장사양 : 노트북 CPU 8Core, 메모리 RAM 16GB, HDD 150GB 여유공간
강좌 난이도: 중-하 /
수강생 수준: Linux 기본 명령문 가능자, 생물정보학 입문자 - vi editor, ssh client (putty, mobaxterm,xshell) 사용가능
구분 | 세션 | 시간 | 강의내용 | 강사명 | 비고 |
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Day 1 | Session 1 | 10:00~10:30 | IT 시스템 최적화 1 - Server, Network, Storage Configuration | 전흥수 | 강의 |
Day 1 | Session 2 | 10:30~11:30 | IT 시스템 최적화 2 - Linux Installation & Optimizing, Hardware Considerations | 전흥수 | 강의/실습 |
Day 1 | Session 3 | 11:30~12:30 | Simple HPC 구축 1 - HPC on Virtualbox, Master Server Installation | 전흥수 | 강의/실습 |
Day 1 | Session 4 | 14:00~15:00 | Simple HPC 구축 2 - Node Deployment, LMOD, Basic Management | 전흥수 | 강의/실습 |
Day 1 | Session 5 | 15:00~15:30 | Backup & Monitoring - OS, FIle Backup / - CLI, GUI Monitoring | 전흥수 | 강의/실습 |
Day 1 | Session 6 | 15:30~16:00 | Local AI 소개 - Hugging face / - OpenLLM + Custom Dataset | 전흥수 | 강의 |