지금까지 마이크로바이옴의 유전체연구 대부분은 16S rRNA gene sequencing 데이터를 활용한 연구 였지만, 박테리아 genus 수준의 동정이외에 얻을 수 있는 결과가 제한적이었다. 최근, Species 나 Strain 수준의 높은 해상도의 균 동정과 그들의 기능분석이 가능한 샷건 메타지노믹스 연구가 계속적으로 증가하고 있다. 본 강좌에서는 샷건 메타지노믹스를 활용한 연구동향 및 실제 시퀀싱 raw 데이터의 특징과 QC, taxonomic profiling, functional profiling 에 대한 기본 분석 개념 및 기법을 소개한다. 미니 데이터를 사용하여 실제 어떻게 적용하고 분석할 수 있는지에 대한 실습을 진행한다.