강좌 정보
2024 제18회 통계유전학워크샵
18th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
단일 세포 전사체 분석 개요
주강사
김종경 (POSTECH)
조교
정유진, 조가연, 조성주, 최은준 (POSTECH)
날짜
2024.07.25 09:30 ~ 2024.07.26 15:30
강좌 방식
이론+실습 / Day1: 온라인-녹화영상, Day2: 오프라인
강좌 정보
단일 세포 유전체 기술의 발전에 따라 단일 세포 수준에서 유전체, 전사체 및 후성유전체 연구가 가능해졌다. 이러한 기술적 진보로 인해 유전체 연구의 패러다임이 기존의 세포 개체군 분석에서 단일 세포 분석으로 급격히 변화하고 있다. 특히 단일 세포 전사체 분석은 발달, 면역, 종양, 노화 등 다양한 생체 및 질환 시스템의 세포 간 변이와 전체 시스템 기능 사이의 인과관계 규명에 필수적인 도구로 사용되고 있다. 본 강좌에서는 단일 세포 전사체 분석의 기본 개념, 다양한 통계 및 기계학습 모델을 배우고 실제 데이터 분석 사례를 소개한다. 강의는 다음의 내용을 포함한다:
• Introduction to single-cell RNA-seq
• Data generation: barcode processing, read mapping, gene counting, cell filtering
• Data processing: normalization, imputation, feature selection
• Exploratory analysis: visualization
• Heterogeneity analysis: clustering, trajectory inference
기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타 (서버 접속)
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
노트북 (메모리 16GB 이상 권장)
수강생 수준
강좌 난이도: 중 / R 프로그래밍 경험이 있는 생물학 전공자
수강생 준비물
개인 노트북
기타 안내사항
-
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 09:30~10:50 Introduction 김종경 강의 (녹화영상)
Day 1 Session 2 11:10~12:30 Data generation, Data processing 김종경 강의 (녹화영상)
Day 1 Session 3 13:30~15:10 Exploratory analysis, Heterogeneity analysis 김종경 강의 (녹화영상)
Day 2 Session 1 09:30~10:50 R programming을 통한 scRNA-seq data analysis 실습 조교 실습 (오프라인)
Day 2 Session 2 11:10~12:30 R programming을 통한 scRNA-seq data analysis 실습 조교 실습 (오프라인)
Day 2 Session 3 13:30~15:30 R programming을 통한 scRNA-seq data analysis 실습 조교 실습 (오프라인)