강좌 정보
2024 제18회 통계유전학워크샵
18th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
롱리드 시퀀싱 기반 암 유전체 분석
주강사
김준 (충남대학교)
조교
-
날짜
2024.07.23 00:00 ~ 2024.07.24 00:00
강좌 방식
이론+실습 / Day1: 온라인-녹화영상 / Day2: 오프라인
강좌 정보

리눅스 기초부터 롱리드 시퀀싱 기반 유전체 분석 튜토리얼까지 진행하려고 합니다. (전사체 안 다룸)

대부분은 영상 및 제가 제공하는 깃허브 홈페이지 텍스트를 기반으로 공부 및 실습하시면 됩니다.

실습을 따라해야만 이후 진행될 대면 강의가 의미가 있으니, 꾸준히 공부하고 실습해두시길 추천 드립니다.

소요 기간은 대략 4-5주 정도인데요, 해당 자료는 실제로 제가 학부 2학년 대상으로 진행하는 실습 수업입니다. Linux 기반 OS가 설치된 컴퓨터만 있으면 언제나 할 수 있으니 수업 이후로도 꾸준히 연습해보시길 추천 드립니다.

이후 대면 강의에서는 최근에 제가 투고한 논문을 중심으로 실제로 어떤 식으로 유전체 지도 작성 연구가 진행될 수 있는지를 소개하려고 합니다. 이와 관련해서는 간단한 실습도 포함할 예정입니다만, 기본적으로는 연산이 많이 필요해 내용 설명 및 질의응답 위주로 진행할 계획입니다. 실제로 고안하고 있는 실험이 있다면 편하게 알려주시면 관련해서 코멘트 드리겠습니다.


기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타 (외부 서버 접속)
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
인터넷 통해서 외부 서버에서 작업할 예정이라, 교육생의 컴퓨터 사양은 크게 중요하지 않음
수강생 수준
강좌 난이도: 중 / Linux 초보자 또는 시퀀싱은 다뤄봤지만 롱리드 시퀀싱 데이터는 다뤄보지 않은 사람까지 넓게 잡음
수강생 준비물
개인 노트북, 실습에 투자할 충분한 시간
기타 안내사항
-
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 00:00~00:00 롱리드 시퀀싱 기반 유전체 지도 작성 소개 (90분) 김준 강의 (녹화영상)
Day 1 Session 2 00:00~00:00 연구 사례 소개 (90분) 김준 강의 (녹화영상)
Day 1 Session 3 00:00~00:00 실습 자료 소개(1) (90분) 김준 강의/실습 (녹화영상)
Day 1 Session 4 00:00~00:00 실습 자료 소개(2) (90분) 김준 강의/실습 (녹화영상)
Day 2 Session 1 09:20~10:50 실습 자료에 대한 해설 김준 강의 (오프라인)
Day 2 Session 2 11:00~12:30 실제 연구 데이터 논문 투고 및 리비전 경험 공유 김준 강의 (오프라인)
Day 2 Session 3 14:00~15:30 해당 연구에 사용한 스크립트 소개 김준 강의/실습 (오프라인)
Day 2 Session 4 15:40~17:10 연구 관련 질의응답 김준 강의/실습 (오프라인)