강좌 정보
2024 제18회 통계유전학워크샵
18th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
NGS를 통한 중개연구
주강사
최무림 (서울대학교)
조교
이지인, 홍성은, 심형태, 김민수, 문현채, 진보영, 황정우, 임소현 (서울대학교)
날짜
2024.07.22 09:20 ~ 2024.07.23 17:00
강좌 방식
이론+실습 / 오프라인
강좌 정보
NGS를 기반으로 하는 유전체학의 발전에 의하여 질병 원인의 유전적 이해도가 가파르게 상승하고 있다. 이러한 경향에 힘입어 유전체학을 이용한 중개연구도 활발히 이루어지고 있으며 이를 통하여 정밀의학으로 대표되는 기초적, 임상적 발전이 이루어지고 있다. 본 강좌에서는 질병의 유전학적 이해를 통한 최근 동향을 알아본 후 중개연구를 위한 여러 종류의 질환 연구의 예시와 실습을 수행할 것이다. 또한 중개연구의 발전에 힘입은 정밀의학의 예시와 실습, 최근 연구 동향을 학습한다. 이를 위하여 NGS 데이터의 해석과 이를 위한 공공 DB의 사용법, 다양한 유전성 질환(희귀질환, 복합질환 등)의 유전체, 전사체 연구 디자인, 분석법, 데이터 해석과 결과의 의생명적 의미 부여 과정을 다룰 것이다. 각 실습 시간은 주강사에 의한 간략한 이론적인 강의와 참여조교에 의한 실제 데이터를 이용한 실습으로 구성되어 있다.
기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
R/Rstudio 최신버전 설치 필요 (교육시간 중 설치, 환경 설정 시간 있음)
수강생 수준
강좌 난이도: 중-하 / 수강생 수준: 제한 없음
수강생 준비물
개인 노트북
기타 안내사항
100% 대면 수업. 실습은 강사의 이론 강의와 조교 실습으로 진행됨
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 09:20~10:50 질병의 유전학적 이해 및 정밀의학의 구현 최무림 강의 (오프라인)
Day 1 Session 2 11:00~12:30 NGS methodology 최무림 강의 (오프라인)
Day 1 Session 3 14:00~15:10 중개연구를 위한 public DB, data repository의 종류와 활용법 최무림/김민수/심형태 강의/실습 (오프라인)
Day 1 Session 4 15:20~16:40 Whole genome sequencing 분석과 Mendelian 질병 원인 규명법 최무림/진보영/김민수 강의/실습 (오프라인)
Day 1 Session 5 16:40~17:00 실습을 위한 컴퓨팅 환경 점검 모두 강의/실습 (오프라인)
Day 2 Session 6 09:20~10:40 Bulk RNA sequencing 데이터 분석 최무림/황정우/진보영 강의/실습 (오프라인)
Day 2 Session 7 10:50~12:10 Single cell RNA sequencing 데이터 분석 (1) 최무림/임소현/문현채 강의/실습 (오프라인)
Day 2 Session 8 13:40~14:50 Single cell RNA sequencing 데이터 분석 (2), scATAC-seq 데이터 분석 이지인/황정우 실습 (오프라인)
Day 2 Session 9 15:00~15:50 공간전사체 데이터 분석 최무림/문현채/임소현 강의/실습 (오프라인)
Day 2 Session 10 16:00~17:00 eQTL 데이터 분석 최무림/심형태/홍성은 강의/실습 (오프라인)